ImageJ – софтуер за анализ и обработка на файлове с изображения. Софтуерът е в състояние ефективно да анализира изображението и да получават подробни технически данни. ImageJ поддържа повечето формати за изображения и има набор от инструменти за редактиране. Софтуерът дава възможност за производство на различни геометрични трансформации, създаване на хистограми за плътност, провеждане на 3D визуализация, изпълнява логически и аритметични операции между изображения и т.н. ImageJ е в състояние да работи едновременно с множество изображения, да прилага различни филтри и провеждане на обработката на партидите на файлове. ImageJ съдържа много plagins които значително разширяват възможностите на софтуера.