Total Commander Ultima Prime – набор от различни софтуерни и допълнителни настройки за разширяване на функционалността на файловия мениджър на Total Commander. Софтуерът помага да се организират файлове и папки, да се извършва търсенето на необходимите данни, да се прехвърлят и изпълняват много други задачи, свързани с управлението на файловете. Total Commander Ultima Prime включва KeePass за управление на паролите, TeamViewer за отдалечен достъп, Gimp и XnView за работа с изображения, AIMP за възпроизвеждане на аудио и др. Софтуерът поддържа обработката на партидни файлове, работи с различни архивни формати и изгаряния компактдисковете. Total Commander Ultima Prime също така дава възможност за персонализиране на цветовата схема, менютата, шрифтовете, прозорците и други аспекти на интерфейса за индивидуални нужди на потребителите.